マインクラフトJava版の［ゲーム設定］タブでバージョンを変更すると、/opt/minecraftのフォルダ内に、vanilla-1.21.1、vanilla-1.21.2のようにサーバーの種類とバージョンごとにフォルダが作成されます。
ワールドデータはそのバージョンごとに保存されるため、新しいバージョンでプレイする際は、新規のワールドが生成されます。
以前のバージョンのワールドデータを引き継ぎたい場合は、SSH接続の上、変更前のバージョンのフォルダからワールドデータを取得し、変更後のバージョンのフォルダへアップロードしてください。
なお、異なるバージョンでは、ワールドデータが正常に動作しない場合もありますのでご注意ください。